5端。1、转录的方向性：DNA转录的方向是沿DNA链的3到5端，为了保证转录的有效进行，启动子需要位于模板链的5端，以便RNA聚合酶能够识别和结合，并开始转录过程。2、编码链的方向性：在描述基因序列时，使用编码链作为方向的基准，而不是模板链，启动子位于编码链的5端上游，实际上也就是位于模板链的5端。