工程履约保函的有效期限一般不超过工程竣工验收后的三个月。具体的有效期根据工程合同中的约定来确定，建议在合同中明确双方协商后的具体期限。

工程履约保函是为了确保工程合同的履行而设立的一种担保方式。其有效期限的设置是为了保障工程项目在实施过程中，承包商按照合同约定履行其义务，直至工程竣工验收并完成相关后续工作。因此，履约保函的有效期限通常与工程进度、验收及后续工作的时间节点紧密相关。

在工程实践中，履约保函的有效期限通常会根据工程项目的具体情况进行设定。比如一些工期较长、技术要求较高的工程项目，履约保函的有效期限可能会相对较长。而对于一些工期较短、技术相对简单的工程项目，履约保函的有效期限则可能会相对较短。此外，合同中约定的具体期限还会受到相关法律法规的制约，因此在实际操作中还需结合法律进行约定。总之，履约保函的有效期限是根据工程实际情况而定的，旨在确保工程合同的顺利履行及双方的合法权益得到保障。

为了保证合同的履行及后续工作的顺利进行，工程双方在签订合同及履约过程中需密切合作并加强沟通，确保履约保函的相关条款得到有效执行。同时，在合同中也应明确双方的权利和义务，以便在出现争议时能够及时解决并维护双方的合法权益。