通常来说，企业与员工签署租住公寓协议并无不当之处。然而，我们仍需关注以下几个方面：首先，合同的制定必须遵循自愿、公正、合法等基本原则；其次，双方当事人需具有完全民事行为能力且意思表达真实；再次，合同条款需符合法律法规要求，如租金设定合理合法，租赁房屋用途及维修责任等细节需明确无误；最后，若以公司名义作为出租方与员工签订合同，务必保证租赁行为符合公司内部规章制度和相关政策。总而言之，只要合同的签订符合法律规定和相关程序，便不会构成违法行为。为了避免潜在纠纷，建议合同条款尽可能详细、严谨。