大学被晚归扣分不会有什么大影响，根据学校宿舍管理条例，进行处罚。一般院系里面会统计，然后辅导员或者领导教育一下。有的学生会被通报，写检查，甚至取消奖励，取消入党资格等，但都不会记入档案。