公司欠款由员工作为补偿主体在法律层面被视为违法行为。法律规定公司应以自身资产承担债务责任。雇员与企业间的联系主要依赖于劳动合同，除非有明文约定，否则员工无须对公司欠款进行补偿。若公司强制要求员工补偿，员工可通过劳动仲裁或向劳动监察部门投诉等途径维护自身权益。同时，员工需妥善保存劳动合同、工资单及工作记录等相关证据，以证明自身无需承担公司欠款。