高速公路的通行费用计算基于车辆实际离站时间。9月30日晚上上高速，10月1日早上出高速的情况是免费的，因为此时上高速处于免费时段，下高速则在免费期内。然而，需要注意的是，如果跨省行驶，如果在10月1日凌晨0点前通过省际收费站，可能会产生费用，建议提前规划行程以避免这种情况。

如果在免费日的最后一天未能在0点前到达目的地，可以在高速出口附近休息，等到0点过后再下高速，这样之前的高速费用将被免除。如果已经出高速，可以掉头回到高速入口继续旅程，但需注意的是，一旦离开高速出口，便不能再享受免费，需要支付剩余路段的通行费。

对于车辆的类型，高速通行免费政策适用于小型客车、轿车、微型客车、微型越野客车和摩托车，但微型货车、轻型货车和特种作业车不在免费范围内，因此驾驶此类车辆的用户需在免费时段内合理安排行程。