化学结构不同。荧光素是一种有机荧光染料，是荧光素酶的底物，是一种可以发出荧光染料，用于检测ATP或其他生化反应，而纳米酶是具有催化功能的纳米材料，二者的化学结构是不同的，因此不是纳米酶。