性质不同，经营范围不同。1、性质不同：农商银行是地方性金融机构，而农业银行是中央管理的大型国有银行，国家副部级单位。2、经营范围不同：农商银行主要是农村、农民、农业业务，而农业银行经营范围广泛，包括个人和企业业务。