该研究所水平高。该研究所的研究水平得到了广泛认可，在生态环境和环境污染治理等领域的研究水平较高，曾多次获得国家科技进步奖和科学技术奖励。中国科学院沈阳应用生态研究所是以林业、农业、环境科学为基础的综合性应用生态学研究机构，其学科定位为以陆地生态系统为研究对象，以现代生态学为主攻学科，主要开展宏观生态学、系统生态学、实验生态学，生物工程与生物技术等领域的研究。