1、首先，审计公司需要仔细审核报审结算内容，特别是对于推翻原投标清单的工程项目，需要重点审核其合理性、合规性以及与工程现场实际情况的符合程度。2、其次，若审计公司认为推翻原投标清单的工程项目存在较大问题，需要向招标方提交审计报告，并说明结算报审清单与原投标清单存在的差异，同时提供相关证据和理由。3、招标方收到审计报告后，需要对结算报审清单进行审核，并对原投标清单的正确性进行核实，若确认原投标清单存在错误，需要对结算报审清单进行修正，并按照修正后的结果进行结算。4、最后，若招标方或相关部门认为审计公司的审计报告存在问题，可以提出异议并要求重新审核，若双方无法达成一致意见，可以按照合同约定的争议解决方式进行处理。