公司补发加班工资是否构成违法须视具体情况而定。基于法律视角，若企业实施补发加班工资的行为违背以下规则，将涉嫌违法：一是未经员工协商一致；二是超出法定加班总时限；三是未能按规定支付全额加班薪酬。我国劳动法规对加班时间和加班报酬均有明确规定，通常每日加班不得超时，每月累积加班亦受限制。此外，加班薪酬的计算亦有严谨规定。如企业在补发加班工资过程中触犯上述规定，员工可依法维护自身权益，通过与企业协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁等途径解决问题。