2019年，南沙口岸申报平行进口整车12844辆，稳居全国第二大汽车平行进口口岸。南沙海关的数据表明，通过实施“先放行入区、后理货确认”的监管模式，跨境电商出口业务得以显著增长，2019年跨境电商BBC进口货值达到146.1亿元，较上一年度增长48.2%。南沙跨境电商保税网购业务在过去几年中实现了跨越式发展，从2015年的0.3亿元增长至2019年的146.1亿元。唯品会南沙保税港区的自建仓在2019年完成了近600万个包裹、超千万件商品的发货量，该自建仓被其公司负责人誉为华南地区中心仓。2019年，全国首单二手车出口在南沙成功启航，全年累计进口汽车12844台，南沙继续保持全国第二大汽车平行进口口岸的地位。此外，2019年，南沙全年出入境邮轮共93艘次，旅客达44.19万人次，稳居全国第三。南沙区政府计划进一步联通与港澳、欧洲之间的货物运输通道，打造“粤港跨境货栈”、“粤澳跨境电商直通车”和南沙保税港区(中欧班列)过境多式联运中心。该区正加快打造区域性拼箱中心和“一带一路(亚洲)货物中转枢纽”，以提升其在国际贸易中的地位。据评估，2019年南沙自贸区“开展跨境贸易便利化”指标在全球模拟排名中位列第45名。