关于公司与员工签署社保协议是否违法之论题，需依协议具体条款及契约背景而定。若协议目标在于规避法定的全面足额缴纳社会保险费用之义务，比如降低缴费基数、选择性停缴特定险种等行为，则此协议应被视为违法。根据我国现行法规，各用人机构对员工应履行法定的全额社会保险交纳义务，该职责无法由任何形式的协议更改或剥夺。然而，如果协议仅对社保支付的具体操作步骤、方法等进行了合法且符合规范的说明和规定，并不涉及规避法律责任的行为，那么它就有可能被认为是合理合法的。总而言之，判断某项协议在法律上的有效性必须考虑到多个不同的关键因素。