区别如下：1、变换性质：坐标变换通常是一种一般的变换，可以包含旋转、平移、缩放等多种形式。而正交变换则是一种特殊的坐标变换，保持向量的长度和两个向量之间的角度不变。2、矩阵形式：坐标变换通常可以用一个矩阵来表示，这个矩阵可以是一个可逆矩阵，也可以是一个仿射变换矩阵。而正交变换的矩阵必须是一个正交矩阵，即其转置矩阵等于其逆矩阵。