该保护生物多样性的最有效措施是建立自然保护区。自然保护区是指为保护、拯救、恢复和管理在自然条件下长期形成或正在形成的生态系统和自然历史遗迹，而划定的特定地域。通过建立自然保护区保护生物多样性，可以有效地保护生态环境和生物多样性，维护生态平衡和生物安全。