其包括样本不足、苛养菌的检出率低。1、样本不足：在自然环境中及模式动物中，每组至少5个生物学重复，一般推荐10个生物学重复；若是人类肠道，粪便等样品，由于个体之间差别较大，建议加大取样量，每组不少于30个生物学重复。2、苛养菌的检出率低：苛养菌的分离监定，药敏试验，不仅是临床迫切需要，而且是衡量一个细菌室技术水平和人员素质的重要标志。