结局如下：1、男主回来了：作者在后记中留下悬念，让读者自行想象。2、男主留在了云之南：在小说中，男主为了保护云南边境的缉毒行动，牺牲了自己。《他在云之南》是一部开放式结局的小说，后记中有作者的一句“你觉得他回来了？”让读者觉得男主可能回来了。但结尾也写到“三哥回不来了，他永远留在了云之南”。