店长扣除员工工休构成违法行为，这是受法律保护的劳动权益。建议先同店长交流，阐明其扣留工休之原因，指出此举违反法律法规。同时，搜集并保存相关证据，如考勤表、工作安排通告以及与店长沟通过程中的记录等。若沟通无效，可向公司人力资源部门反馈，请求协助处理。若公司内无法解决，可向当地劳动监察机构投诉或申请劳动仲裁。劳动仲裁委员会将依据所提供的证据及相关法律条文作出裁定。总而言之，必须依法维权。