45.9公里。南京禄口机场位于中国江苏省南京市江宁区禄口街道，南京站位于中国江苏省南京市玄武区，驾车行驶两地相距45.9公里，需40分钟，途经：宁宣高速、内环东线，共经过4个红绿灯。