有隔菌丝和无隔菌丝。真菌的菌丝一般分为有隔菌丝和无隔菌丝，其中有隔菌丝的真菌是一类真核微生物，一般从形态上分为酵母菌、霉菌及担子菌三大类；无隔菌丝为长管状单细胞，细胞质内有多个核，其生长表现为菌丝的延长和细胞核的增多。