外观不同、基因不同。1、外观不同：美短矮脚猫外形来看，脚很短，个子自然也比美短矮，甚至体长也会比美短短。2、基因不同：美短矮脚猫属于基因缺陷产生的，美短的基因缺陷很少，所以遗传性的疾病也很少。