针对企业将餐饮补贴从员工工资中扣除是否违法的问题，需要具体情况进行评估。如果在双方签订的劳资合同以及企业内部政策中有明确约定将餐饮福利通过工资形式发放，并且这部分扣除符合规定，那么一般来说并不违法。但是如果事先并未有明文协商，企业就擅自扣除员工工资中的餐补项目，这种做法很可能是违规行为。根据法律法规，工资应该依照劳动合同上的条款，足额、准时地支付给工人。如果您对企业的做法存在疑虑，首先可以查阅劳动合同及企业相关规定，若确认其行为合规性存在问题，我们鼓励您搜集相关证据，譬如工资条、合同等文件，然后向当地劳动监察部门或者申请劳动仲裁，切实保障自己的利益。