公司停业期间是否应支付员工薪资，需依实际情况判定。若公司严格遵循劳动合同约定，在停业期间照常支付员工薪水，则通常并不违法。但如公司与员工事前已就停业期内薪资支付方式或金额进行明确约定，且获得双方共识，如此按照协议进行操作亦合规。然而，如公司在停业后未能依法按时支付员工薪资，便属违法行为。此时，员工可行使权利，依据《劳动合同法》等相关法律规范，向公司索要欠付薪水，甚至可能同时争取经济赔偿。因此，权衡公司停业期内发薪是否违规，主要看其行为是否符合法律法规及劳动合同之约。