员工薪资扣除并非违法，具体情况需视公司政策及员工表现而定。如若公司按照既定合法规章制度对员工因违规行为（如旷工）或违反劳动纪律等原因进行工资扣除，并不构成违法。然而，若公司无缘无故地进行工资扣除，便可能涉及法律问题。例如，即使公司未能达成业绩指标，也无法以此为由扣除员工工资，除非有明确的劳动合同条款且遵循法规要求。此外，从员工工资中代扣代缴其本人承担的社会保险费、个人所得税等费用则属合法范畴。归根结底，判定薪资扣除是否合法的关键取决于公司是否具有明确依据与合规流程。