在种蛋孵化过程中，相对湿度是仅次于温度的关键因素。鸭蛋在孵化期间，蛋内水分持续向外蒸发，适宜的蒸发速度对胚胎的正常生长发育至关重要。若水分蒸发过快或过慢，均可能导致孵化率下降和雏鸭质量受损。相对湿度过低会导致蛋内水分快速蒸发，增加胚胎与壳膜粘连的风险，造成出壳困难，同时影响孵化率和雏鸭体重。相对湿度过高则会阻碍蛋内水分的正常蒸发，延缓胚胎发育，导致出雏率降低和雏鸭健康问题。因此，湿度控制应遵循“两头高，中间低”的原则。在孵化初期，相对湿度应保持在65%至70%之间；中期调整为60%；后期则控制在70%至75%。如湿度不足，可适当喷洒温水以增加湿度。孵化机的加湿系统通常采用气体雾化方式，均匀对称的雾化是保证两侧温度平衡的关键。气压过高或过低都会影响加湿效果，甚至可能损坏设备。适宜的气压一般为0.65至0.8兆帕，以实现最佳的加湿效果。多数孵化机内装有干湿球温度计或相对湿度计，用于准确监测孵化环境中的相对湿度。