会。根据39健康网资料显示，沙眼衣原体感染会留档案。沙眼衣原体是一种病原体，感染人体后主要侵犯眼部，可导致沙眼，也是一种性传播疾病，由沙眼衣原体感染引起的疾病，主要通过性接触传播。感染沙眼衣原体后，可能会导致沙眼，也有可能导致生殖器疾病，如尖锐湿疣、尿道炎等，少数也会引起眼部疾病，如角膜炎、倒睫、眼球肉瘤。感染沙眼衣原体后，通常需要4-6周的时间才能治愈，治愈后衣原体导致的各种症状，以及体征会持续存在，会遗留在细胞中，一旦发现衣原体感染，应及时治疗，避免造成更多的损害。